恩格斯的妻子瑪麗·白恩士早逝，身邊也沒有子女。他最早指定馬克思爲遺産唯一繼承人。馬克思去世後，他又多次修改遺囑，並在彌留之際對遺囑進行若幹補充。在遺囑中，他將馬克思的全部著作手稿和信件移交給馬克思的法定繼承人—女兒愛琳娜。自己和馬克思的全部藏書贈給德國社會民主黨領導人倍倍爾和辛格爾。他還有大約3萬英鎊的財産，3/8給了馬克思的女兒勞拉和愛琳娜，1/3給了馬克思長女小燕妮的孩子們，1/4連同家具贈給了他的秘書路易莎。其余財産一部分給了德國社民黨作活動經費，一部分給了妻子的侄女瑪麗·艾倫·羅舍。在遺囑中，恩格思還說：“我希望將我的遺體火化，而我的骨灰，一有可能就把它沉入海中。”
1895年8月5日，恩格斯與世長辭，其骨灰罐沉入了大海。