根據全球流感共享數據庫的數據,新加坡至今共上傳292組B1617系的變種病毒基因組序列。其中,在過去四周就上傳了51組B1617系毒株的基因組序列,占本地同一時期內上傳所有基因組序列的91%。
新加坡過去四周上傳至全球流感共享數據庫的病毒基因組序列中,有超過91%是B1617系的變種毒株,比率爲全球第二高。受訪專家認爲,這顯示本地近日相對大規模的本土病毒傳播,主要通過幾起境外輸入病例引發,這項數據有助于公共衛生機構更好地應對病毒傳播。
根據全球流感共享數據庫(Global Initiative on Sharing All Influenza Data, 簡稱GISAID)的數據,新加坡至今一共上傳292組B1617系的變種病毒基因組序列。其中,在過去四周就上傳了51組B1617系毒株的基因組序列,占本地同一時期內上傳所有基因組序列的91%,僅次于伊朗的100%。在數量方面,新加坡上傳的B1617系毒株基因組序列,則排全球第五。
除了B1617系,新加坡也一共上傳182組B117系變種毒株,其中一組在過去四周內上傳。B1351系病毒株方面則共有75組,其中三組是過去四周內上傳。另外,新加坡也一共上傳六組P1、四組B1427和B1429,以及五組B1525變種毒株,我國過去四周沒有上傳屬于這三種病毒株的新序列。
亞太臨床微生物學與傳染病學學會會長淡馬亞教授受訪時說:“新加坡上傳的病毒基因組序列顯示,這裏過去四周的情況與英國和澳大利亞相似,也就是病毒從少數途徑傳入本地並出現較多的本土傳播。這跟美國和德國有較多的輸入型病毒不同,這樣的數據有助公共衛生部門制定更合適的應對措施。”
新加坡國立大學蘇瑞福公共衛生學院副院長(研究)古阿烈副教授則指出,由于每個國家上傳的數據完整性不同,對比實際上傳序列數量的意義不大。不過,每個國家上傳的基因組序列中不同變種毒株的比率,倒是具有參考價值。
毒株基因組序列比率反映各國冠病疫情演變
“數據顯示英國和印度的德爾塔(Delta,即B16172毒株)變種毒株的占比相似,而新加坡上傳的德爾塔變種毒株比率則是全球第二,顯示這個變種毒株已經取代了本地之前看到的毒株,也反映出它的傳播力更強。”
淡馬亞教授也指出,毒株基因組序列的比率也能更好地反映各國冠病疫情演變的性質。其中,過去幾周英國上傳B117變種毒株的基因組序列比率不斷減少,B1617毒株基因組序列比率則正在增加。
全球流感共享數據庫目前是全球最大的病原基因資料數據庫,是在全球暴發禽流感後于2008年成立,至今已經累積超過187萬組冠病毒株的基因組序列。新加坡科技研究局(A*STAR)及旗下生物資訊研究院是數據庫重要合作方之一。
淡馬亞說:“全球流感共享數據庫的數據由各國受認證的合格實驗室上傳,讓研究人員共享資料,任何虛假的數據也能被用戶快速辨識出來並提出質疑。與其他數據一樣,富裕國家有更多資源完成更多排序並上傳更多資料。不過,數據庫也意識到這一點,並已爲中低收入國家的科學家提供培訓。”