新加坡基因組研究院的科學家開發一種新工具,使用人工智能技術來識別和歸納新基因,可適用于不同物種和樣本的分析,有助進一步了解細胞的功能。
Bambu是以竹子命名,類似竹子有極長的莖稈,它是一種使用長讀長測序技術的單細胞轉錄組測序(long-read RNA Sequencing)工具,可用于臨床和研究項目,以探究脫氧核糖核酸(DNA)如何編碼新轉錄本(novel transcripts),並對其進行定量分析。
Bambu采用機器學習模型,對候選轉錄本進行排名,以評估它們代表生物學相關産物的可能性。換言之,新工具可判斷候選轉錄本是否具有可能對生物學過程具重要的功能或參與生物相關活動,並進行排列。
新加坡科技研究局(A*STAR)星期四(6月15日)發文告說,旗下基因組研究院(Genome Institute of Singapore,簡稱GIS)的科學家開發了名爲Bambu的新工具。
文告說,新工具以高度准確和敏感地識別新的轉錄本,並對其進行定量分析,從而對生物體的基因結構有更全面的理解。
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研究人員借此能在研究領域中識別新的基因、蛋白質和其他元素,並更深入地研究那些目前尚研究不足的生物體。通過發現新基因,尤其是那些從臨床樣本中發現的,也可促成研究人員鑒定生物標志物(biomarker),用于早期檢測疾病或作爲治療靶點。
轉錄本是由一條基因通過轉錄形成的一種或多種成熟的信使核糖核酸(mRNA),它們具有編碼蛋白質所需的信息。新轉錄本指的是,未被鑒定或注釋的轉錄本,可能是由新的基因或已知基因的未知轉錄變體産生的。通過使用新的技術或分析工具,科學家可發現和鑒定這些轉錄本,進而研究它們的功能和與疾病相關等信息。