抗戰結束，內戰尚未正式大開打，一場雷雨一架飛機，摔死了可能是中共最大的對手之一，戴笠。軍統死了戴笠後，毛人鳳接過了衣缽（這是一個在特務史上被輕視的對手，如果縱觀其一生，包括其執掌軍統-保密局後，其心智和手段，我個人認爲在當時中國諜報界排進前五是沒有問題的）
作爲軍統內的文官系統，在大老板死後，其位置並不穩固，爲了樹威，他首先幹掉了在江湖傳聞中對戴笠的死有嫌疑的軍統老人馬漢三。
馬漢三
隨後，毛人鳳特別調集了三十個左右的省站站長，在南京舉辦了一個站長講習班。一個月講習完畢後，又專門請蔣介石接見所有調訓的站長和出席“三一七”工作會議的代表，地點仍舊是黃埔路中央軍校後面他的官邸辦公室。他照例點名之後，首先對毛人民調整各省站長的辦法表示極爲贊許。
毛人鳳
這樣，毛人鳳完成了他執掌軍統-保密局後最大的人事布局，也對他以後掌控國民黨最大的情報特務系統打下了紮實的基礎。
喬家才
北平站，先後由黃天邁、喬家才、王蒲臣、徐宗堯任站長；
河北站（設保定），由楊清植、孔覺民先後任站長；
天津設有兩站，一站專搞一般情報，二站專搞外事情報，一站由吳景中、李俊才先後任站長，二站由黃天邁任站長；（潛伏中的天津站便是以一站爲原型背景）
吳景中全家妻兒合影
山西站爲田唆；
晉南站爲王明江；
山東站爲許先登；
青島站爲梁若節；
蔣緯國曾經給梁若節的書信
河南站爲劉暨、劉茂欣、楊蔚；
陝西站爲候定邦。王鴻駿；
甘肅站爲任冠軍；
新疆站爲余萬選、饒鐵珊；
拉薩站爲譚興沛、蕭崇清；
雲南站爲王巍、蘇子鵲、沈醉；
徐遠舉、沈醉，周養浩
貴州站爲錢養林、周養浩、陳世賢、汪劍英；
川西站（蓉站）爲楊超群、呂世琨；
重慶站爲李修凱；
康定站爲董士立；
湖北站爲余克劍、黃藩初、謝經武；
鄂北站爲楊振铎；
湖南站爲唐乘骝、黃康永、夏松；
江西站爲鄧樹勳、王邁夫；
安徽站爲唐玉昆、翁一窺；
南京站爲葉翔之、鍾貢勳、黃加持、張明揚；
王新衡
上海站爲王新衡、劉芳雄、王方蘭；
蘇南站爲李修凱、陳楚之；
蘇北站爲陳轶珍；
浙江站爲章微寒、毛萬裏；
福建站爲陳達元、王調勳；
陳達元
閩南站爲沈觐康；
台灣站爲郭壽華、林頂立；
廣東站爲鄭鶴影、馮德恭、鄭星搓；
廣西站爲蘇業光、鍾可莊；
香港站爲李惟棉、謝力公、楊華波、劉芳雄（上海站調任）；
承德站爲諸大光；
沈陽站爲荊有章；
長春站爲崔志光；
南滿站爲股勉、諸大光；
北滿站爲王力、項乃光；
四平站爲張靜宣；
熱河站爲龍超、徐政。
文強
在國外設站的有韓國。西貢、新加坡、曼谷、開羅、卡拉奇、菲律賓等。有些站以上又有過一些高一級的組織，如東北督導室，由文強任主任；西南特區，由徐遠舉任區長；西北特區，由胡子萍任區長。
另外，軍統還有相當多的委員會、處科室等機構，許多老資格的特務都在各個部門擔綱首腦。
毛人鳳年輕之時
而毛人鳳在敗退台灣後，曾向一個密友透露過自己的做官秘訣全在忍、等、狠三字。人說毛人鳳像龜，取的就是他能屈能伸的性格。別人當衆搧他耳光，毛人鳳微笑自若， 蔣介石 脫下鞋幫往他臉上亂打，毛人鳳說這是領袖的愛戴，心字頭上一把刀，毛人鳳堅信忍能避禍，也能爲升官發財鋪好路徑。