深圳在著名大學和頂級研究機構上差距大，在科技領軍企業上形成了一定的優勢：
近年來，與香港、新加坡、西雅圖的等世界先進城市比較，深圳科技創新能力突飛猛進，超過香港，但仍低于新加坡、西雅圖。
科技創新是城市經濟發展的內生動力，對一個城市經濟持續向好發展具有至關重要的作用。深圳、香港、新加坡、西雅圖四個城市在不同層面上都體現出較強的科技創新能力，但深圳在著名大學和頂級研究機構上差距大。
香港具有香港科技大學等6所世界著名大學，基礎研究能力強。
新加坡有新加坡國立大學等2所世界著名大學，有生物醫藥、信息、制造等多個領域的先進研究院所，基礎研究及基礎應用研究能力強，科技産業化水平高。
西雅圖有華盛頓大學等多個世界著名大學，有華盛頓技術中心等多個高端研究院所，有微軟等世界頂級科技公司，科技基礎研究、基礎應用研究及其産業化能力都很強；深圳有國家級科技企業約5500家，科技應用研究及其産業化能力強。但四個城市在科技研發投入、科技人才數量、科技領軍企業等方面還存在較大差異。
四市科技創新能力對比
通過表示，我們發現在基礎研究及基礎應用研究上，深圳沒有著名的大學與科研院所，層次明顯落後于其它三個城市。在科技領軍企業代表上深圳形成了一定的優勢，與新加坡、西雅圖差距在縮小，明顯強于香港。
深圳在全社會研發投入上仍顯不足，深圳因去年華爲407億人民幣的研發投入，領先其它三個城市。但若去掉華爲公司的數據後深圳的研發投入將大幅下降，僅爲GDP1.47%，比國家科技部統計的2014年2.1%平均水平還低0.63%，顯示深圳在研發投入上與先進城市還有差距。
深圳頂尖人才數量與新加坡、西雅圖還有顯著差距，西雅圖、新加坡高端科技人才分別打到35萬人和29。5萬人。
四城市科技創新比較結論：
從綜合創新要素比較看，深圳的科技創新能力高于香港，而遠低于新加坡和西雅圖，尤其是世界著名大學、一流研發機構、頂級科技企業、高端科技人才差距巨大，這些重要的科技要素決定著科技創新能力的根本提升，需要深圳著眼長遠、科學謀劃、紮實積累，無法在短期內一蹴而就。