本報記者 吳奕萱 見習記者 杜卓蔓
2月1日,浙江省疾控中心上線自動化的全基因組檢測分析平台。記者獲悉,浙江的全基因組檢測分析平台由浙江省疾病預防控制中心、阿裏達摩院醫療AI團隊和傑毅生物技術公司共同研發。據阿裏巴巴介紹,使用該平台可將原來數小時的疑似病例基因分析縮短至半小時,大幅縮短確診時間,並能精准檢測出病毒的變異情況。
據了解,目前醫院普遍采用核酸檢測方法,只能檢測到病毒基因的局部。相關人員表示,由于病毒存在變異的可能性,對于整個基因序列來說這種檢測方法猶如盲人摸象,一旦病毒發生變異,就可能出現漏檢的情況。
不同于核酸檢測方法,全基因組檢測技術對疑似病例的病毒樣本進行全基因組序列分析比對,能夠有效防止病毒變異産生的漏檢,並將原需數小時的全基因分析流程減少到半小時,大幅提高疑似病例的確診速度和准確率。
據悉,新型冠狀病毒感染的肺炎疫情發生後,達摩院算法專家顧斐博士立即奔赴浙江省疾控中心,第一時間針對新型冠狀病毒基因進行特征分析,並推出多個算法模型。在序列比對過程中,達摩院對算法增加了分布式設計,有效提升比對效率;在病毒序列拼接階段使用分布式設計的deBruijn圖算法,變異病毒也能精准檢測。
浙江省疾控中心基因測序負責人孫逸博士介紹說,這個平台基于阿裏雲的強大算力與達摩院新算法可以爲病毒的解析提供支撐,基于該平台,未來還可以在短時間內將檢測範圍覆蓋整個確診病例,也爲後續疫苗與藥物研發打下了堅實基礎。
(編輯 白寶玉)