國家傳染病中心設有門診服務，門診病患從踏入一樓的診室起，就會由護士篩檢分成兩個源流。普通病患與有傳染風險的病患在完全隔離的兩個區域就診。
診室設有專門的X光室、抽血室和藥房等設施，普通病患在診室一站式完成檢查、就診、付款和拿藥的流程後，從專門通道離開，減低傳染的可能。
有傳染風險的病人則進入特別隔離區，按傳染途徑分成呼吸性與接觸性源流就醫。需住院的病人，則通過專門走道與病人專用電梯轉至病房。
記者走訪發現，診所的唯一入口處是公衆最容易與傳染病人有直接接觸的區域。
國家傳染病中心主任梁玉心解釋，入口處專門設計成寬闊的流動空氣區，病人傳染給公衆的概率很小。
在舊傳染病中心工作了15年的高級護士長陳靜（36歲）說，搬來新中心後，工作效率提高了，工作環境也更安全。
“以前給有傳染風險的病患照X光，不是要帶病人到另一個地方，就是要找移動式X光機就地檢查，現在一站式服務，效率大大提高。新設施也給予前線醫護人員更多安全保障，例如現在我們休息區與病房區的空調系統就完全隔開。”
國家傳染病中心目前已有三分之一的設施投入運作。待今年5月全面啓用後，中心將成爲本地的傳染病醫療樞紐。