共有八名議員參與《內政團隊科技局法案》的辯論，他們提出了下列疑慮與關注。
① 隱私
電眼監控、畫面分析與臉部識別等科技應用能夠幫助內政團隊防止罪案發生，但同時也存在民衆覺得被實時監控的隱憂。不少議員希望科技局更好地解釋，會如何保護民衆隱私。
②資料保護
預料科技局下來會掌握大量數據和個人資料，議員認爲該局應該制定一套完善的程序，確保所收集的資料是受到保護的。
③跨部門信息分享與合作
在把各部門科技與科研人員集中在一個單位後，科技局應維持正在進行的合作，在目前的廣泛科研生態中與其他機構和單位建立夥伴關系。
④ 減少工作重複
目前在公共領域以科技與科學研究爲專責的部門和單位衆多，議員擔心成立科技局會分散現有科研機構的資源，也認爲應盡量避免跨機構的工作出現重複。
⑤ 人才編配
本地勞動市場對有科技專長的人才需求高，議員希望了解科技局的人手編配，也希望在人員整合的過程中，能爲這些專業人員規劃更清晰的職業發展道路。