全基因組排序能把結核病感染群的範圍縮小,追蹤接觸者的工作人員就能更快、更准確地找到感染群。國家傳染病中心至今利用這個方法找到三個感染群,分別爲去年10月公布的後港1巷第174D座租賃組屋感染群,以及今年1月公布的兩個勿洛投注中心感染群。
結核病在本地未完全消除,去年的新增病例大致上持平,國家傳染病中心最近開始利用全基因組排序更准確地找出感染群,以控制病菌傳播。
前天是世界防治結核病日,根據衛生部發布的最新數據,去年本地居民中新增1370起結核病例,比前年略少12人,其中近八成病例在新加坡出生。
年長者與男性較容易患病,去年約七成病例爲年滿50歲者,約65%爲男性。
結核病發生率大致上不變,去年每10萬名本地居民有33.9人患病,前年則爲34.7人。
去年11月,國家公共衛生實驗室開始爲所有測出有結核菌樣本的基因組脫氧核糖核酸(DNA)進行全基因組排序,以辨識它們是否有同個感染源。實驗室是在前年底開始爲部分樣本排序,隨後逐步接收更多樣本。
之前分析法針對性較低 所找到感染群範圍很大
國家傳染病中心至今利用這個方法找到三個結核病感染群,分別爲去年10月公布的後港1巷第174D座租賃組屋感染群,以及今年1月公布的兩個勿洛投注中心感染群。
在使用全基因組排序之前,當局是用分子分型法如簡稱爲MIRU-VNTR的分析法爲樣本分型。
國家傳染病中心國家結核病項目副主任黃熙玲醫生前天受訪時說:“MIRU是另一種排序方法,只能辨識基因組的一小部分,針對性相當低,找到的感染群範圍很大,病例之間也沒有明顯關聯。”
反之,全基因組排序能把感染群的範圍縮小,追蹤接觸者的工作人員就能更快、更准確地找到感染群。
黃熙玲說,用全基因組排序輔助結核病例的追蹤工作是相對較新的方法,在全國層面進行結核菌樣本全基因組排序的國家不多。
國家傳染病中心前天邀請媒體到國家公共衛生實驗室參觀,並講解全基因組排序如何運作。
實驗室會從新加坡中央醫院或國立大學醫院的結核病實驗室收到結核菌基因組DNA,把它分成可閱讀的短片段進行排序,再通過生物信息分析查出DNA特征,整個過程耗時七天至12天。
本地冠病病例的病毒樣本也會送去做全基因組排序。黃熙玲說,如果是冠病,追蹤接觸者的工作人員通常已經知道病患接觸過誰,再用全基因組排序佐證。
然而,結核病的潛伏期很長,可以長達好幾年,病患發病時通常記不得接觸過誰,因此工作人員得先看病菌基因組是否有相似之處,才去訪問有關病患。