天下網商記者 張超
自從阿裏雲宣布向全球公共科研機構免費開放一切AI算力後,何萬青博士就進入了連軸轉狀態,經常工作到淩晨。作爲阿裏雲高性能計算團隊負責人,他要對接大量科研機構、高校院所以及化學、生物醫學專家的需求。
這些機構和專家,在這個特殊的階段,都是想快捷利用阿裏雲的超大規模算力,來縮短藥物研發周期,以盡早讓相關的疫苗、特效藥上市,控制住新型冠狀病毒感染肺炎疫情。
比爾·蓋茨(左二)參加GHDDI啓動儀式
2017年,GHDDI成立的第二年,阿裏雲就開始爲GHDDI的各類新藥研發、化合物篩選等提供算力支持。
在新型冠狀病毒感染肺炎疫情發生後,GHDDI也在1月27日上線了“一站式科研數據與信息共享平台”,這是一個基于阿裏雲的藥物研發和大數據平台,主要功能有四個:
針對SARS/MERS等冠狀病毒的曆史藥物研發進行數據挖掘與集成;
開放相關臨床前和臨床數據資源;
計算靶點和藥物分子性質;
跟進新型冠狀病毒最新科研動態,實時向科學界和公衆公布,爲新型冠狀病毒科學研究提供重要數據支撐。
全球健康藥物研發中心GHDDI
說起來很簡單,實際上新藥研發卻是個費錢費力更費時間的過程,數據顯示,在美國研發一種新藥,從項目啓動到被FDA(美國食品藥品監督管理局)批准上市,平均需要花費10-15年的時間,耗資超過13億美元。
目前,針對新型冠狀病毒疫苗和新藥的研究,已經完成了“毒株分離”的“濕實驗”,“基因測序”工作也已經結束,接下來就要了“幹實驗”階段。“幹實驗”階段,涵蓋對病毒靶點進行識別和驗證、尋找對應化合物等過程。
GHDDI針對此次新型冠狀病毒蛋白質序列實現部分靶點的同源建模工作
特別重要的是,面對人類共同的敵人-病毒,公共科研機構更需要無需排隊,隨時可以得到彈性伸縮、數據交流和發布更加方便的協同環境。
“在全國人民爲配合切斷病毒傳染途經而自我隔離的情況下,阿裏雲彈性高性能計算EHPC平台和超級計算集群SCC恰好解決這個燃眉之急。這也印證了阿裏的一句土話‘此時此刻,非我莫屬’。”何博士說。
何萬青博士
而GHDDI上線研發平台後,也致謝阿裏雲團隊協助部署後端並提供計算資源。
何萬青博士團隊中還有很多技術專家,比如孫相征和余洋等人,目前的工作就是對接GHDDI以及各類科研機構、專家們的需求。
這些計算機科學領域的大牛說,他們並不是醫學專業出身,能做的只是爲研究人員提供算力保障、優化技術支持和應用答疑等“後勤工作”,讓科學家能夠專注于學科本身的科研突破,而無需耗費太多精力去學習“交叉學科”的計算技術,但是他們看到了越來越多的生物醫學專家加入了進來,感受到了“很強的使命感”,大家都在用自己的綿薄之力,加速對新型冠狀病毒的研究以及相關藥物、疫苗的研發。