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印度輸入!中疾控周報披露首次檢出“隱形”奧密克戎變異株細節

2022 年 10 月 2 日 张玮昆仑宏观

1月3日晚,《中國疾病預防控制中心周報(英文)》在線發文披露了我國首次檢出“隱形”奧密克戎變異株的具體情況。

印度輸入!中疾控周報披露首次檢出“隱形”奧密克戎變異株細節

《周報》介紹,2021年12月19日,一名31歲的男性登上了從印度布巴內斯瓦爾飛往印度孟買的航班,然後又從孟買飛往阿曼馬斯喀特。12月24日,他從馬斯喀特乘飛機回到廣州,被轉移到佛山的一家集中隔離酒店。他在隔離的第三天接受了核酸采樣,于2021年12月27日核酸結果呈陽性。當天,該病例被負壓救護車送往廣州市第八人民醫院隔離治療。根據胸部CT檢查發現雙肺局部性炎症。

2021年12月28日,廣東省疾控中心對輸入病例的鼻拭子標本進行測序。2021年12月29日,測序分析得出結論,該病毒基因組屬于BA.2譜系,爲奧密克戎變異株。與武漢參考序列比較,該病例菌株顯示67個核苷酸變異位點。在進化分支上報道的序列最類似于2021年12月20日在新加坡和2021年12月1日在澳大利亞報道的序列。在蛋白質水平上,共觀察到49個氨基酸突變位點和9個氨基酸缺失,其中棘突蛋白有27個突變和3個缺失。

2021年11月26日,奧密克戎變異株被世界衛生組織(WHO)列爲第五種“需要關注的變異株”。研究表明,奧密克戎變異株進化爲3個譜系,分別爲BA.1、BA.2和BA.3,其中以BA.1譜系最爲流行。BA.2譜系被非正式得稱爲“隱形的奧密克戎”,它不同于“標准”品種,缺少一種特殊的基因變異。全球共享流感數據倡議組織(GISAID)上傳了89條BA.2序列,大部分序列來自南非、丹麥、加拿大、英國、美國、印度等國家。最早的BA.2序列于2021年11月27日在南非上傳。

《周報》指出,該病例是在我國發現的首個BA.2譜系患者。由于BA.2譜系的基因組差異,其生物學特性和傳播率可能有所不同,因此需要進一步研究和長期監測。

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