新加坡近期提交給一個全球流感病毒研究平台的數據顯示,本地積極譜出的冠病病毒基因序列中,近半屬于奧密克戎,而且這個比率還在增加。
根據全球共享流感數據倡議組織(GISAID)的數據,新加坡過去四個星期一共上傳387個奧密克戎排序,占上傳所有排序的48.3%。新加坡也是全球上傳奧密克戎排序第18多的國家,我國奧密克戎病例占了近五成,在26個上傳超過300個奧密克戎排序的國家中排名第10。
這個比率也有上升趨勢。本地去年12月2日出現首兩起奧密克戎病例,到12月8日就已上傳13個奧密克戎毒株排序。以四個星期爲一個時間段,那段期間的奧密克戎普遍程度只有1.8%。
這個比率過後持續上升,到12月20日奧密克戎普遍程度提高到12.2%,27日激增至34.4%,到了本月3日則達43.7%。
新加坡科技研究局生物資訊研究院副院長(研究)莫勒—斯特羅(Sebastian Maurer-Stroh)受訪時解釋,新加坡上傳的排序數量是以過去四周爲一個時間段,並不反映所有病例。排序包含境外輸入和本土傳播病例,本地大部分奧密克戎病例都是入境旅客。
本地最初是通過進行全基因組排序來確診奧密克戎毒株。根據本報了解,隨著改變確診奧密克戎毒株的定義,本地只會對特定人群,例如境外輸入病例和屬于感染群的病例進行排序,可能因此測出更多奧密克戎。
衛生部醫藥服務總監麥錫威副教授前天也在記者會上指出,本地奧密克戎病例持續增加,以總體病例來說,過去一周奧密克戎占本土病例約18%。今年1月3日當天,奧密克戎占新增病例的26.4%。
各國上傳排序可助 國際公共衛生組織制定策略
各國也加快排序工作,莫勒—斯特羅指出,去年12月全球單月上傳排序數量突破100萬個,超過疫情第一年總數。
他說:“積極譜出奧密克戎毒株排序,能協助國際公共衛生決策者制定策略,觀察奧密克戎毒株的傳輸速度和模式。重要的是,我們要知道病患感染哪個變種毒株,判斷病毒的相對嚴重程度。我們開始收集這些數據,並用以制定新規則和反應措施。”